為了達成「非核家園」的目標，政府計畫在2025年設置20GW以上容量的太陽能發電裝置，但是在推廣校園種電的過程中，許多問題因為相關法規配套不足而一一浮現，甚至更凸顯出中央政府與地方的資源差距；抑或是地方政府對政策的方向和執行力度不一，讓校園種電形成了顯著的區域差異。
系列回顧：
【校園種電總體檢Part1】班班有冷氣前 全台中小學都做太陽能發電嗎？
【校園種電總體檢Part2】綠能多了，綠樹沒了？中小學設太陽光電的幾個考量
3成學校有違建 為光電解套方式爭議多
監察院曾於2014年糾正教育部，這份調查報告指出，全台有1089所學校校舍無建造執照及使用執照，約占全國總數31.82%。在當時，違建不可進行任何的改造與施工，使得屋頂型光電在校園普及第一步就碰到困難。
後來開始有業者呼籲政府放寬違建設置光電板的規定，高雄市於2016年首創先例，在不影響公共安全的前提下，開放民眾申請違建屋頂轉太陽光電。後來經濟部也在2017年放寬四米五以下的違建，可以用以下四種形式，申請裝設光電板。
延伸閱讀：高雄如何克服違章問題，將鐵皮改為綠能屋頂？
截至2020年7月為止，台灣的違章建築仍多達68萬7千多戶。天泰能源董事長陳坤宏指出，雖然中央已放寬規定，讓符合特定條件的違章建築能免申請雜項執照來設置太陽能板，但事實上改革只做了「半套」。
陳坤宏說：「民眾提出申請以後，到了地方政府這關，為了確認違建狀態不會影響公共安全，他還必須向工務局提出『違建諮商』，審查完成才能施工。那很多民眾聽到要做諮商，會怕自己的房子會被列為待拆物件，就反悔決定不做太陽能板了。」陳坤宏呼籲，政府應該要提出更全面的措施，讓民眾能安心加入屋頂種電的行列。
一紙共同供應契約 造就國立與市立的距離
目前全台公立的中小學，建設太陽光電比率僅有35.8%，但根據教育部2020年7月的報告，由部內管轄的國立學校有86%已經完成太陽能板建置，也就是說，代表在全國學校數佔不到4%的國立學校，在全台完成裝設的中小學中占了一成的比例，可見國立學校與縣、市立學校的種電比率，兩者有不小的差距。
台南女中總務主任劉靜豪指出，國立學校所採取的做法，是先由教育部先統一審查光電廠商，確認廠商的服務和價格都沒問題後，再將所有履約內容整合成「共同供應契約」。「共同供應契約」指的是當有兩個以上的機關，對同樣的設備有共同的需求時，為了簡化採購流程，可由主管機關與廠商簽訂制式化的合約，各機關只要到政府電子採購網點選請購，就能快速進行採購程序。
對於人力有限的中小學行政處室，簡化採購流程，省去繁文縟節，自然也就讓裝設完成率有漂亮的數字表現。劉靜豪說：「有了共同供應契約，學校想要裝設太陽能板就不用再辦理自行招標，更不用耗費大量的時間撰寫撰寫需求文件和走流程，只要下載既有的表單來填寫即可，非常方便。但如果是由市政府管轄的國中小，多數都還沒有共同供應契約可使用，學校想裝太陽能板，只能走原本的招標程序，就會比較麻煩。」
能源政策推動順利否 關鍵在地方政府
地球公民基金會主任蔡卉荀認為，再生能源講求因地制宜，地方政府才是能源政策成功與否的關鍵。由於能源轉型牽涉綠能、節能等面向，補助經費常常是分散在不同的局處裡，若沒有成立專門的綠能辦公室並進行人才的培訓，很容易就出現業務難以整合、缺乏整體規劃策略的情形。
以自居「綠能首都」的彰化縣來說，104年起便由縣府主導，集合了180家學校屋頂，租給廠商種電，有效降低材料採購成本，提高廠商回饋金比例，也因此有越來越多學校願意投入。2018年縣府再增設經濟暨綠能發展處，讓相關業務由專責單位進行，提高效率。
而建置率吊車尾的花蓮縣，前縣長傅崐萁2017年在議會答詢時，認為花蓮尚「不宜」在國中小屋頂種電，認為花蓮是觀光大縣，憂心太陽能板會破壞掉花蓮的自然景觀，而影響到觀光的收入。花蓮民眾也擔心地震頻繁的問題，可能導致太陽能板容易損壞，裝設意願不高。
冷氣搶先「開學」 用電缺口怎補足？
即使政府和民間都同意，先發展屋頂型光電是對環境衝擊較小的路徑，校內要全面進行太陽能發電，要克服的關卡仍然很多，更別說達到100%的普及率了。
眼看2022年的班班有冷氣，以及2025年再生能源達到20%的目標迫在眉睫，尋找更多其他的屋頂種電成為急切的課題。今年7月28日由屋頂型太陽能的公聽會上，經濟部報告去年(2019)各類屋頂種電的成果，如下表。